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工学院
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张桂珊

职称:讲师

办公室:行政中心207

Email: gszhang AT stu.edu.cn


教师简介

张桂珊,讲师,硕士生导师。2020年在中山大学获工学博士学位。2020年11月起担任汕头大学工学院电子系讲师。研究方向为机器学习、生物信息计算、数据挖掘、模式识别,主要是面向生物数据的人工智能算法研究。在Briefings in Bioinformatics、Computers in Biology and Medicine等国际知名期刊发表多篇论文,拥有国家授权发明专利2件,并担任Computational and Structural Biotechnology Journal 等学术期刊审稿人。


授课课程

本科生:基本电路理论(2021-2022春、2023-2024春)

本科生:数据库原理(2021-2022秋、2022-2023春、2023-2024秋)

研究生:生物信息计算(2021-2022春、2022-2023春、2023-2024春)


科研项目

1. 国家自然科学基金青年项目,2022.01-2024.12,主持。

2. 广东省自然科学基金面上项目,2022.01-2024.12,主持。


代表性论文

1. Ye Luo, Yaowen Chen, HuanZeng Xie, Wentao Zhu, Guishan Zhang. Interpretable CRISPR/Cas9 off-target activities with mismatches and indels prediction using BERT. Computers in Biology and Medicine. 2024 Feb;169:107932.

2. Guishan Zhang, Ye Luo, Zhiming Dai, Xianhua Dai. Benchmarking deep learning methods for predicting CRISPR/Cas9 sgRNA on- and off-target activities. Briefings in Bioinformatics. 2023 Sep 22;24(6):bbad333.

3. Guishan Zhang, Tian Zeng, Zhiming Dai, Xianhua Dai. Prediction of CRISPR/Cas9 single guide RNA cleavage efficiency and specificity by attention-based convolutional neural networks. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2021.

4. Guishan Zhang, Zhiming Dai, Xianhua Dai. C-RNNCrispr: Prediction of CRISPR/Cas9 sgRNA activity using convolutional and recurrent neural networks. Computational and Structural Biotechnology Journal. 18 (2020): 344-354.

5. Guishan Zhang, Yiyun Deng, Qingyu Liu, Bingxu Ye, Zhiming Dai, Yaowen Chen, Xianhua Dai. Identifying circular RNA and predicting its regulatory interactions by machine learning. Frontiers in Genetics. 11 (2020): 655.


发明专利

1. 张桂珊等,一种基于机器学习的circRNA与miRNA、RBP相互作用关系的预测方法,2022-06-21,专利号:202110634359.4

2. 张桂珊等,一种基于集成学习的circRNA-miRNA相互作用关系预测方法,2022-03-22,专利号:202110634358.X


科研奖励

国家三等奖,“兆易创新杯”第十六届中国研究生电子设计竞赛(参赛作品:智能院前心肺复苏急救关键技术及系统集成研发),2021(共同指导教师)

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